埃斯比约vsAB格莱萨克瑟比分预测（埃斯比约vs科治）
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rnaseq数据分析
转录组分析，是研究特定时空条件下细胞中基因转录产物的组成和表达情况的一种方法。广义上，转录组包括信使RNA、核糖体RNA、转运RNA以及非编码RNA等。狭义上，转录组分析通常指对所有mRNA进行的分析，旨在揭示不同基因的表达情况。
在进行RNA-seq分析处理的上半部分，首先需要了解测序文件的准备，包括fastq格式的序列文件。这些文件包含了来自Illumina测序平台的双端测序数据，每个样本对应两个文件，即seq_fastq.gz和seq_fastq.gz。
RNA-seq（RNA测序）是一种先进的转录组研究技术，它利用高通量测序平台来直接测量细胞中的RNA分子数量。这种技术能够提供关于基因表达的定量信息，包括未知基因的发现、已知基因的表达水平变化、以及可变剪接事件等。
fastq文件的格式为*.fastq，存储了测序数据。文件中包含了每个测序读取的碱基质量和质量得分，通过特定的编码方法表示碱基的准确度。质量得分通过计算误差概率得到，以确保数据质量和可读性。在进行实验前，需要准备注释文件和基因组文件，这些文件将帮助后续的分析工作。
在进行Bulk-RNAseq数据分析时，首要步骤是使用STAR和Rsubread软件进行比对和定量，最终目的是获取counts文件。首先，需要在服务器上安装Anaconda，然后下载并安装STAR。在安装成功后，需要构建基因组索引文件，这需要提供基因组的fa文件和注释的gtf文件。通过输入命令，可以构建所需的索引文件。
在比对完成后，产生了关键的.bam文件，通过分析这些文件，可以获取比对信息。如需提取所有样本的比对日志，利用for循环即可完成。最后，使用Rsubread进行比对与定量分析，尽管在服务器上遇到了一些bug，但通过在本地运行R程序解决了这一问题。
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