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- 1、全长转录组
全长转录组
Smart-seq2单细胞全长转录组测序是一种广泛应用于生命科学领域的先进技术,其由Rickard Sandberg教授开发并改良,主要应用于全转录组范围的单细胞RNA测序。百奥智汇提供Smart-seq2服务,本文将详细介绍其技术概要、核心原理和实验流程、应用领域及案例、样本准备与运输注意事项。
全转录组不是全长转录组,全转录组说的是检测普通mRNA,加上 lncRNA,miRNA,CircRNA这样的3种常规 非编码基因,而全长转录组说的是测序的时候采取三代测序等技术这样可以把基因的转录产物的全部长度的碱基一次性测序到,这样很方便知道不同可变剪切转录本的区别。
这项技术在2013年公布,专注于对带poly(A)尾巴的RNA分子进行转录组全长扩增及高通量测序,采用了改进的Smart-seq2方法,实现了高灵敏度、低偏好性的cDNA扩增,确保了转录本的整体覆盖情况。Smart-seq2技术能够深入检测细胞内的融合基因、可变剪切、基因位点突变等信息。
并直接进行基因/转录本的定量分析,成为经济高效的转录组测序技术。诺禾致源始终坚持以客户为中心,关注客户需求和技术更新。即将上线的Kinnex全长转录组将采用全新交付形式,根据不同的研究目标推荐测序数据量。通过提供5Mb、10Mb等HiFi reads形式的测序数据,更好地服务于科研学者的科研目标。
年2月PacBio试剂升级,加深零模波导孔深度,片段偏好性逐渐降低,提高大片段测序检出率,构建不筛选片段+大于4Kb片段的混合文库可以改善长转录本较多的物种,增加测序到长转录本的概率,数据量产出高且稳定。
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